Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATE1O95260 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATE1O95260 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATE1O95260 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATE1O95260 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATE1O95260 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATE1O95260 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms