Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP19O94966 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP19O94966 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP19O94966 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP19O94966 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP19O94966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP19O94966 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP19O94966 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP19O94966 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
USP19O94966 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms