Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKAP2O75563 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKAP2O75563 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms