Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms