Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms