Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PPFIA2O75334 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PPFIA2O75334 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms