Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM4AO75164 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM4AO75164 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms