Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF3O75054 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms