Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKNO60260 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKNO60260 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKNO60260 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms