Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXTL3O43909 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXTL3O43909 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms