Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EDIL3O43854 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EDIL3O43854 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms