Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRNO43815 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRNO43815 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRNO43815 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRNO43815 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRNO43815 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRNO43815 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRNO43815 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms