Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA2O43364 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms