Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIAH2O43255 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIAH2O43255 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIAH2O43255 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIAH2O43255 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIAH2O43255 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIAH2O43255 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIAH2O43255 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms