Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYNC1LI2O43237 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms