Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CRXO43186 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRXO43186 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRXO43186 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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