Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBDO15205 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBDO15205 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBDO15205 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBDO15205 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBDO15205 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBDO15205 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBDO15205 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBDO15205 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms