Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BCKDKO14874 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BCKDKO14874 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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