Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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AGRNO00468 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AGRNO00468 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AGRNO00468 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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