Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPIPA5E9PKD4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPIPA5E9PKD4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms