Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SOBPA7XYQ1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SOBPA7XYQ1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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