Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEMP2A6NFY4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEMP2A6NFY4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms