Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PALM3A6NDB9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms