Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VWA3AA6NCI4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA3AA6NCI4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms