Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms