Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
XIRP2A4UGR9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XIRP2A4UGR9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms