Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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TRBV30A0A0K0K1B3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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