Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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TRBV24-1A0A075B6N3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV24-1A0A075B6N3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRBV24-1A0A075B6N3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRBV24-1A0A075B6N3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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TRBV24-1A0A075B6N3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV24-1A0A075B6N3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV24-1A0A075B6N3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV24-1A0A075B6N3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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