Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DAZL-202ENST00000399444 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CD163L1-202ENST00000416109 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF184-201ENST00000211936 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC008966.1-203ENST00000499459 3137 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MEF2C-222ENST00000514028 3393 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CTNNA2-203ENST00000402739 3684 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 GRIA2-201ENST00000264426 3445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ADIPOQ-AS1-201ENST00000422718 3443 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CSTF1-201ENST00000217109 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DISP1-201ENST00000284476 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM169-201ENST00000295658 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 TGM4-201ENST00000296125 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 FCGR3B-202ENST00000367964 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 REG4-203ENST00000369401 2327 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PREPL-202ENST00000378511 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
KRTAP6-3Q3LI67 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms