Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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