Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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