Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
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HOXD13P35453 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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HOXD13P35453 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD13P35453 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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