Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CXCR2-201ENST00000318507 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SLC22A9-201ENST00000279178 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 SCRN3-201ENST00000272732 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 POU2F3-201ENST00000260264 2903 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 ABLIM3-202ENST00000326685 4164 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HERC1Q15751 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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