Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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