Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 GUCY1A2-203ENST00000526355 16205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 OR4Q3-202ENST00000642117 2165 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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COL4A6Q14031 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
COL4A6Q14031 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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