Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPRBQ9Y5M8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms