Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RHBDD3Q9Y3P4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RHBDD3Q9Y3P4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms