Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9Y3F1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9Y3F1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms