Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOBEC2Q9Y235 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC2Q9Y235 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms