Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVW-1Q9UQF0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVW-1Q9UQF0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms