Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SHOC2Q9UQ13 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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