Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM35Q9UPQ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM35Q9UPQ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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