Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAF8Q9UPN6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms