Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN11Q9UMQ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms