Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
INO80Q9ULG1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
INO80Q9ULG1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms