Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PALD1Q9ULE6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms