Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX41Q9UJV9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX41Q9UJV9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms