Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RIMS3Q9UJD0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RIMS3Q9UJD0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms