Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NPC1L1Q9UHC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms