Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPP1R1BQ9UD71 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPP1R1BQ9UD71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms